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集成了流域地理信息系統、污染物遷移轉化模型、地表水水動力及水質模型、水環境污染負荷及容量分析、水生態系統綜合模型和水生態修復及水處理技術應用模型。
通過數值模擬和復雜大系統優化算法為流域水環境綜合治理和水資源利用提供全面的、優化的、動態和精準的科學決策支撐和評估。
為了方便進行藻類爆發與富營養化模擬研究，系統提供了藻類動力學過程的動態空間輸出和顯示功能，使用戶可以在模擬進行的任何時刻，查看模擬水體內任何位置的藻類生長率，呼吸率以及營養鹽和光照限制因子等，幫助研究人員了解藻類動力學的內部過程，分析引起當前模擬結果的內部機制，判斷模型的可靠性和合理性，并為進一步的模型校驗和響應分析提供重要的信息。
系統模型軟件包含完備的水質生態環境指標，可以有模擬1維，2維，及3維水循環，水溫、染料示蹤劑，普通污染物泄漏的遷移轉化，拉格朗日粒子跟蹤模擬，溶解氧、有機營養鹽（碳，氮，磷，硅），無機營養鹽（碳，氮，磷，硅）、藻類（3個藻類種群），水生植被（多達5個種群的水生植被），大腸桿菌、水齡，以及內源污染物與富營養化動力學過程等。
因此，系統可以廣泛適用于國內環境保護以及水利部門的研究院，設計院，和大專院校的學生和老師作為進行智能流域管理，水污染總量控制規劃，區域污染修復工程的水質水生態效用評估，湖泊與湖濱濕地模擬，水環境影響評價，水質水生態動力學研究，水污染泄漏風險評估，預警系統構建，以及構造決策支持系統的軟件平臺。
